余杭市小百花越剧团的历史可追溯至1955年，当时两支越剧团——余杭县众艺越剧团和德清县新立越剧团合并成立了建新越剧团。随后，经过多次更迁和重组，该团在1961年恢复为余杭县建制，并在1978年再次恢复为原名。该团以其男女合演、文武兼备的特色，为社会带来了《杨门女将》、《十里红妆》等经典作品。

历任主要领导包括茅桂兰、杨小楼、陶显玲以及张国根等。在艺术人员方面，有汪小桢、杨淡风、徐水蓉等人贡献卓著。80年代末，受到了政府支持，该团吸收29名女学员进行培训，最终于1994年成立了面貌焕然一新的余杭市小百花越剧团。

自此之后，该队创作并上演了《罗家小将》、《魂断深宫》、《杨乃武》三部作品，其中《罗家小将》获得“五个一工程”奖，《杨乃武》获省戏剧节编剧及演出奖。此外，朱晓勤、张惠芳成为了青年才俊，而李霄雯、高慧芳则是该队的小百花之星。此外，90年代的主要领导有谭均华、莫桂松，以及李雪华、何敬德和王文圭，他们共同推动了该队的发展。