余杭市小百花越剧团的历史可追溯至1955年，当时两支艺术团体——余杭县众艺越剧团和德清县新立越剧团合并成立了余杭县建新越剧团。随后，经过几番更迁与重组，该团在不同的时期被命名为余杭县越剧团、临安县越剧二团以及再次恢复为余杭县建制下的原名。在1965年的合并中，它与另外两支队伍联合，形成了今日的分隶体系。1978年，随着社会文化环境的改善，该队得以重新独立运作。

该群体以其独特的男女共演和文武兼备风格，在表演《杨门女将》、《十里红妆》等经典戏曲中产生了深远影响。历任领导包括茅桂兰、杨小楼、陶显玲和张国根，他们带领着汪小桢、杨淡风及其他多位艺术家共同推动了该领域发展。

80年代末期，为了振兴这支传统艺术集体，政府举办了一项全省范围内招募女性学员计划，最终在1994年成功培养出了今天我们所知的面貌焕然一新的余杭市小百花越剧团。在接下来的五年间，这个舞台上排演出九部大型作品，其中三部是由本集体创作的，并且获得了各种奖项，如优秀编剧奖、最佳演出奖等。此外，《罗家小将》还荣获1997年的“五个一工程”奖，而《杨乃武》则在省级戏曲节上赢得多个殊荣。

当前主要成员包括朱晓勤与张惠芳，以及李霄雯、高金采芳和洪燕琴等人。而90年代期间，该机构主要由谭均华、莫桂松领导，他们受到了李雪华、施敬德以及王文圭等人的支持。