在古代的一个困难年头，南京遭遇了严重的自然灾害和经济危机，百姓们饱受苦难。然而，这些灾情中最为人心所痛的是皇家救济金被贪官周吉私吞一空，民众告状无门。正值此时，一位清廉的巡按徐青奉命来到南京，以调查处理这些冤情。此时，不仅有百姓前来诉苦，还有一名李月素向巡按徐青揭露了一段十八年的旧账：她指出十八年前的丈夫杀手竟然是徐青本人的父亲，这让巡按徐青陷入了人性与职责之间的深刻挣扎。而周吉也利用这点试图逃脱法律制裁。经过慎重考虑，巡按徐青做出了一个极其艰难的人生抉择，他决定将自己的生父和罪犯一起处决。这场关于忠诚、正义与牺牲的戏剧展现了《巡按斩父》中的复杂情感和道德冲突，让观者对人物深感同情，同时也引发人们对于历史背景下权力与个人责任关系的一种思考。