余杭市小百花越剧团的前身可以追溯至1955年，时为余杭县众艺越剧团与德清县新立越剧团的合并产物——余杭县建新越剧团。随后，该团在1957年正式定名为余杭县越剧团，再次更迁至1961年恢复原名后的余杭越剧团。在此期间，1965年该团与两支其他演出队伍合并形成了两个分支单位，而到了1966年的思想文艺宣传队成立，这一过程中多次调整和重组最终导致1978年4月11日又一次恢复了原名。自此之后，该艺术群体以其独特的男女合演、文武兼备特色，为社会带来了诸如《杨门女将》、《十里红妆》等经典戏曲作品。此间，有着重要影响力的领导人包括茅桂兰、杨小楼、陶显玲及张国根，以及著名艺术人员汪小桢、杨淡风、徐水蓉等。

80年代末期，为了振兴这家戏班，余杭市委和市政府共招募29位女学员，并经过五年的培训于1994年成功创立了面貌焕然一新的余杭市小百花越剧团。在短短五年的时间内，他们排出了九部大型戏曲，其中包括三部由该团自己创作的作品，如《罗家小将》、《魂断深宫》以及《杨乃武》，这些作品不仅参加过省内新剧目会演，还获得了多项奖项，如优秀导演奖和作曲奖。此外，《罗家小将》还荣获1997年度首届“五个一工程”奖，而《杨乃武》的编剧则获得省第八届戏曲节最佳编剧奖。

90年代初期，该公司主要由谭均华、莫桂松等领导人带领，其主要成员还包括李雪华、高敬德以及王文圭。而作为下一代艺术家的代表人物，则有朱晓勤和张惠芳，以及李霄雯、冯小娟、三位金采芳、小洪燕琴及魏晓燕等精英人才。