余杭市小百花越剧团的历史可追溯至1955年，当时两支艺术团体——余杭县众艺越剧团和德清县新立越剧团合并成立了建新越剧团。随后，经过多次更迭和重组，该团在1957年被正式命名为余杭县越剧团，并历经临安县的管辖、恢复原名以及与其他两支队伍的合并分离，最终在1978年4月11日恢复为余杭县越剧团。

该集体以其独特的男女合演和文武兼备的特色，在表演《杨门女将》、《十里红妆》等传统经典作品上取得显著成就，其前任主要领导包括茅桂兰、杨小楼、陶显玲、张国根，而知名艺术家有汪小桢、杨淡风、徐水蓉等。

80年代末期，为了振兴这支古老戏曲群体，余杭市委和市政府组织了一批女学员进行培训，最终于1994年成功建立了面貌焕然一新的余杭市小百花越剧团。在接下来的五年内，该集体排出了九台大戏，其中包括创作自家的三部作品《罗家小将》、《魂断深宫》、《杨乃武》，并且参加了多个重要表演活动获得了一系列荣誉奖项。此外，《罗家小将》还赢得了1997年的首届“五个一工程”奖，而《杨乃武》则获得了省第八届戏曲节的一系列奖项。

当前，这个集体拥有青年才俊朱晓勤和张惠芳，以及资深演员李霄雯、冯小娟、高采芳洪燕琴以及魏晓燕。90年代，该集团的主要领导人包括谭均华、莫桂松，他们受到了由李雪华、施敬德以及王文圭所担任的指导。