《巡按斩父》讲述了在古代某个年份，南京遭受了严重的自然灾害，百姓们生活在极度困难之中。为了救济这场灾荒，皇家拨款的救赈粮食却被贪官周吉私吞不顾，这让无助的百姓找不到申诉的途径。此时，一位清廉的巡抚徐青奉命来到南京进行调查。他接到了大量民众告状，他们希望通过正义的手段获得补偿和安慰。然而，当李月素向徐青揭露十八年前自己丈夫遇害案件中的真相——那名凶手竟然是徐青自己的父亲时，徐青陷入了一场痛苦而艰难的情感与道德冲突。周吉也试图利用这一点来逃避法律的制裁。在经过深思熟虑之后，徐青做出了一个决定：他选择了以法律为依据，将自己的生父和一起处决。这一剧情展现了一种超越家族恩怨、坚守公正原则的人格魅力，也展示了戏曲艺术如何将复杂的情感纠葛转化为震撼人心的情节。